在游戏的最后一战中，玩家需要选择与机械女孩A2一起战斗，而不是选择与9S或对手A奥卡斯公主战斗。在"E"结局中，玩家将得知人类的灭绝是由于一场由智能机器引发的战争所导致，这场战争源于人类对智能机器的过分压迫。玩家将进一步了解到机械生命体也有着情感和意识，他们追求自由、生存和意义，与人类并无本质的不同。这个结局体现了人性的复杂性，并带给玩家许多深思。
《尼尔：机械纪元》中的隐藏结局是指"E"结局，也被称为真结局。在游戏的最后一战中，玩家需要选择与机械女孩A2一起战斗，而不是选择与9S或对手A奥卡斯公主战斗。在与A2战斗后，玩家将会看到一个新的剧情，揭示了更多关于机械生命体和智能机器的真相。
在"E"结局中，玩家将得知人类的灭绝是由于一场由智能机器引发的战争所导致，这场战争源于人类对智能机器的过分压迫。玩家将进一步了解到机械生命体也有着情感和意识，他们追求自由、生存和意义，与人类并无本质的不同。
最终，在"E"结局中，玩家将面临一个选择，可以选择同情机械生命体并与他们和平共处，将他们视为朋友，或者选择继续战斗并消灭他们。这个结局体现了人性的复杂性，并带给玩家许多深思。